در تابستان 1403 تعدادي از دانشجويان اين دانشگاه در دانشگاه علوم پزشكي هوشمند دروسي به صورت مهماني اخذ نموده اند كه پس از دريافت نمرات از آن دانشگاه، براي برخي از دانشجويان غيبت اعلام شده است كه بر اساس آئين نامه هاي آموزشي غيبت غيرموجه دانشجو در امتحانات درس به منزله نمره صفر مي باشد اما دانشگاه علوم پزشكي هوشمند طی نامه شماره 1351 / ج م / 1403 مورخ 14 / 08 / 1403 اعلام نموده است كه "عنوان غيبت براي دانشجوياني كه در آزمون حضور نداشتند و مطابق سياست هاي آن دانشگاه مبني بر عدم تاثير غيبت در كارنامه دانشجويان باشد و صفر لحاظ نگردد" كه اين با آئين نامه هاي آموزشي موجود منافات دارد.